Su especialidad es la Producción orgánica de hortalizas; Calidad de productos hortícolas para industrialización; Fisiología y manejo de cultivos hortícolas en invernaderos y aire libre.

Actualmente es Director del Departamento de Horticultura y Coordinador del Centro Tecnológico de Suelos y Cultivos.

Muñoz-Vega P.; Paillán H.; Serri H., Donnay D.; Sanhueza C.; Merino E.; and J. Hirzel. 2016. Effects of organic fertilizers on the vegetative, nutritional, and productive parameters of blueberries 'Corona', 'Legacy', and 'Liberty'. Chilean Journal of Agricultural Research vol.76 (N° 2): 201-212

Vásquez, C.; Céspedes, C.; Paillán, H.; Vargas, S. 2012. Organic Management of Horticultural Crops: In Organic Horticultural Production INIA Newsletter N ° 232 : 80-110 Pp.

Design and development of a bacteria based supplement for sustainable horticulture. Bio-Economy International /BMBF Alemania. 2014-2017. Investigador y miembro Consortium BoHiBak Leibniz-Institut für Gemüse und Zierpflanzen e.V. / Utalca. Cooperación internacional.

Empleo de Rizobacteria (Enterobacter radicincitans) como tecnología sustentable para mejorar la productividad y rentabilidad de sistemas hortícolas. FIC-R. 2013-2016. Investigador Responsable. Científico-Tecnológico.

Joint PhD Program in Agricultural Economic (J-PPAE). Deustscher Akademischer Austauch Dienst (DAAD). Alemania. 2010-2014. Cooperación internacional.

Fortalecimiento de la docencia e investigación científica y tecnológica en la Facultad de Ciencias Agrarias de la Universidad de Talca mediante la incorporación de capital humano avanzado. MECESUP. 2009-2012. Investigador responsable. Cooperación Internacional.

Paillán H. (Inv. Resp), Schmitd H, Zettel C. Desarrollo de un Modelo de Red de Granjas para la Innovación y Transferencia Tecnológica en Agricultura Orgánica. BMBF-Conicyt. 2008-2009. Investigador responsable. Científico-Tecnológico.

Extensión de la época de cosecha y de la presencia en el mercado de frutilla nativa chilena. 2007-2011. FIA. Co-investigador. Científico-Tecnológico.

Alternativas de manejo integrado para los principales problemas técnicos en la producción orgánica de frutas y hortalizas. 2007- 2011. FIA. Investigador responsable. Científico-Tecnológico.

Diagnóstico de los cambios en suelo de uso agrícola en diferentes sistemas de producción. CONICYT/BMBF. 2007-2008. Investigador Responsable en Chile. Cooperación internacional.